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尼比科学博物馆坐落在尼比市北部，是这里的一大景点，同时也是关都地方唯一一座博物馆。博物馆主要展出关于宇宙和化石的内容。
尼比科学博物馆有两层。一层是前台，里面有化石翼龙和镰刀盔的骨架化石展出。二楼是太空展，包括有航天飞机以及月之石的展出。进入博物馆需要交付50元参观费。可以在地图上使用一字斩以后，主角可以进入博物馆的后门，屋里有研究员可以令秘密琥珀复活为化石翼龙。在火叶版中，这里会教授地球上投。
在第二世代，博物馆关闭。在第四世代中，博物馆进入商业运营，但是因为主要展览不在这里，所以是免费进入的。只开放一层，有研究员可以复活主角的化石，因为使用岩石粉碎时有一定几率发现化石。前丰缘地方的冠军大吾也会出现在这里，在这里见过他之后前往希鲁夫公司的话，他会用他的铁哑铃换主角的佛烈托斯。
正当中午时，小茂正在小刚的提醒下，来到了博物馆门前。经历了一番苦战才拿到灰色徽章的小茂也正想好好的放松一下，博物馆倒也是个不错的选择，而且在游戏中，这里可谓是个惊喜之地。不过，博物馆现在能不能给小茂带来惊喜，就也只能进去看看了。
一踏进博物馆，小茂就被眼前赫然出现的化石翼龙的骨架所震慑住了。清晰无比的骨架宛如化石翼龙再现般出现在小茂的眼前，每一处的骨头都是那么的清楚。保存完好化石很好的将曾经的天空霸主再次展现在世人眼前。
走到二楼的太空展览馆，寥寥无几的游人，明显太空馆的人气就比一楼的化石馆要低得多。不过让小茂很感到意外的是，太空馆除了有一座一比一的宇宙飞船的模型外，四周还陈设着不少的月之石。“没想到现在还有这么年轻的人对陨石有兴趣！”一声沧桑的声音在小茂的身后传来，小茂回头一看，就见到一位身穿白大褂，白发苍苍的老者。
“陨石？”
“这些是月之石，也叫月亮石。”老者一本正经的解释道：“传说，月亮石就是皮皮们乘坐的宇宙飞船。”
“噗嗤~”对老者的话，小茂不禁莞尔笑道：“无稽之谈！”
“你不认可这个传说吗？”老者怒问道：“这可是在尼比市流传了数百年的传说。”
“传说也要有依据。”小茂开始对老者进行了讽刺：“来，麻烦你坐上月亮石飞起来给我看看！”
“你……”老者有些被小茂激怒的说不出话来，但稍微平静了下后，老者有开始倚老卖老起来：“我吃过的盐比你吃过的饭还要多，我难道会不知道这个传说是真是假吗？”
小茂懒得和这么无知的人交谈，正准备离开之际，楼下就突然传来一阵骚动。稍微反应过来的小茂便冲到楼下，就看见一只沙瓦郎被人群团团围住。
“这是？”小茂不知道为什么这只沙瓦郎总有一种似曾相识的感觉。
在众多人中，沙瓦郎一眼就认出了小茂。强力的大腿一下就跃过人墙，一记飞踢朝着小茂踢去。小茂一个侧下腰，就与沙瓦郎的飞踢擦脸而过。
“我认出你来，你是爷爷后院的那只沙瓦郎。”一下茅塞顿开的小茂恍然道：“没想到你追到了这里！”
当日，与飞天螳螂没有打完那场战斗，一只成为了沙瓦郎心中的遗憾。为了完成那场未完成的战斗，沙瓦郎背井离乡，离开了大木研究所，追逐小茂的足迹来到了这里。
“好厉害~”众人无一不被小茂的身手所惊到，毕竟能和小精灵过招的人类，屈指可数。
“我想你最想见到的是它吧！”见到一脸怒火的沙瓦郎，小茂掏出了精灵球在手指上旋转了起来。