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零以及他的族人乘坐着方舟号飞船离开了。目的地是——系统星云，这个由一切因缘巧合所指向的星云。
新星上的人类，在后期，几乎花费了所有的时间和精力去研究这片星云，最终将下一个人类适居地确定为系统星云中的——机车星。
令他们所感到不解的是，系统星云的一切运转规律貌似都是提前设定好了的似的，似乎已经早早的在那里等待着，等待着新时代人类的降临。
在向机车星航行的过程当中，有一个声音一直回荡在零的脑海中。
“只要人类还有意识，就会随之产生情感，随后就会产生各种私欲。最终，不论此文明的科技发展的有多么繁荣，都难逃灭亡的结局。”老舰长了空的话一直回荡在零的脑海里。
零回忆起老舰长，那是一个在新星上万人敬仰的存在。不过最终因为在战争中，依然不愿意放弃被欲念所控制的人类，他选择以牺牲自己的方式，希望能够唤醒他们心底的良知。
不过，也许他的想法过于幼稚了，他的这一做法不仅没有达到目的，反而让那些被欲念控制的人类没有了最后一点顾及，变本加厉的到处去掠夺资源，残害同类，加速了星球的灭亡。
最终，零带领着族人，在老舰长的指引之下，前往深海，在方舟号飞船内发现了一个装置。
这个装置叫做——原子分割机，那时候零发现，原来舰长当初在确定了新星人类发展方向后，就隐隐约约猜中了这个结局，在科技发展过程中，暗中部署了这一切。
当零来到原子分割机的控制室时，看到能够让装置启动的能量槽下方，刻着舰长的提示语。
“如果人类在未来真的重蹈覆辙，请有缘人毫不犹豫的启动它！”